A Escola foi criada em 1972, pela portaria nº562, de 28 de Setembro, situando-se na Vila da Calheta, nas instalações pertencentes à Santa Casa da Misericórdia. Designava-se então Escola Preparatória Simão Gonçalves da Câmara, onde funcionava apenas o ciclo preparatório.

Só em 1976/77 foi criado o ensino unificado. As limitações e condicionalismos físicos desta escola levaram à construção de um conjunto de três edifícios no sítio da Vargem – Estrela que iniciaram a sua actividade em 22 de Novembro de 1981.

Este conjunto foi posteriormente ampliado, em duas etapas, e a escola é actualmente composta por cinco edifícios. Pela portaria nº20/94 de 21 de Fevereiro, foi criada a Escola Básica e Secundária da Calheta. A evolução seguinte aconteceu com a construção de um pavilhão gimnodesportivo, visto tratar-se da uma carência de vulto a nível de recursos físicos disponíveis. Posteriormente construiu-se a piscina que entrou em funcionamento no ano lectivo de 2006/2007, encerrando assim os ciclos de crescimento da escola em termos de infra-estruturas.

O nosso símbolo é composto por um francelho de cor azul e pode ser explicado por duas vertentes: a cor azul simboliza o céu, o mar, o espaço, a cor dominante na Terra; o francelho é uma ave de rapina típica da zona de implantação da escola e era frequentemente avistado a sobrevoar a zona sobranceira ao mar e significa a liberdade, o espaço, a identidade regional.